广东出入境检验检疫局由原广东进出口商品检验局、广东动植物检疫局和广东卫生检疫局合并组建,是主管广东(不含深圳、珠海)出入境卫生检疫和动植物检疫,以及进出口商品检验、鉴定、认证和监督管理的行政执法机构,于1999年8月正式挂牌成立,直属国家质量监督检验检疫总局。
该局在全省20多个市县及重要口岸共设立各级检验检疫机构106多个,共4000多名检验检疫人员。现该局配置的仪器设备达3亿多元,如气相色谱仪、液相色谱仪、荧火分光光度计、原子吸收光谱仪等国内外先进精密仪器设备,其纺织品、金属材料、化学、食品等4个检测中心被认定为国家级科技成果检测鉴定机构。